患高熱驚厥的孩子治療效果究竟能達到什么程度，目前不能一概而論。大多數病人的治療效果比較明顯，但也有一些孩子預后不太好，這與判斷孩子是否需要長期用藥的觀點相一致。

如果孩子在高熱驚厥發作前就有不正常的神經系統的表現，例如：腦性癱瘓、CT 或核磁共振顯示出大腦有移行障礙等，驚厥發作次數頻繁，發作時間長，腦電圖也不正常，這種孩子的預后就不很樂觀了。其中一些患兒將來有可能轉變成癲癇；一些可能會有輕度的智力低下；部分患兒還可能會有學習困難。這是因為驚厥可造成腦細胞的缺血缺氧，如果驚厥時間長，就有可能造成腦細胞不可逆性的損害。但是并不是所有患兒都一定會轉變成癲癇。

導致癲癇的危險因素有以下幾點：
1、 如果孩子在發生高熱驚厥前神經系統發育就不正常，像小多腦回畸形、神經原位異常癥、腦穿通畸形、腦灰質異位等等，這種孩子發生癲癇的危險率最高。
2、 一次高熱驚厥時間超過10分鐘或在一次高熱中發生2次驚厥，而孩子在2次驚厥時意識不清楚，就說明腦缺氧的時間較長。
3、 如果孩子在1歲以前發生熱性驚厥或1年內頻繁發生，都是轉變成癲癇的危險因素。

有些學者認為腦內一個叫顳葉的組織，它的內側發生硬化就是因為高熱驚厥引起的。而顳葉硬化是造成癲癇發作的一個重要因素。所以了解了高熱驚厥孩子的預后，就可在醫生的指導下，決定孩子的治療。