基因突變是產生此類細菌的根本原因。但在自然狀況下，變異菌在不同微生物的生存斗爭中未必處于優勢地位，較易被淘汰。

　　抗生素的濫用則是這類細菌今日如此盛行的導火線！由于人類濫用抗生素，使得原平衡中的優勢種被淘汰，而這種“抗抗生素”的細菌則樹立成長的成為了優勢種，取得了生存斗爭的優勢地位，從而得以大量繁衍、傳播。

　　綜上，基因突變是產生此類細菌的根本原因，抗生素的濫用對微生物進行了定向選擇，導致了超級細菌的盛行。所以，一方面，我們在尋找解決途徑的同時，必須注意對抗生素等物質的使用。否則，超級細菌的生存狀況將迅速從“優勢”走向“盛世”。另一方面，我們應該積極探索，繼續尋找解決方案，而不能過分悲觀，因為優勢與盛世的距離從不小于劣勢與失敗。