接種疫苗后，由于疫苗本身的特性，如異種蛋白的刺激，疫苗中的熱原質或毒性等原因，少數被接種者可于接種滅活疫苗5～6小時，或24小時左右出現體溫升高，一般持續1～2天左右，很少超過3天以上。注射活疫苗出現反應的時間稍晚，但消失亦很快。除體溫升高的反應外，個別人可能伴有頭痛、眩暈、乏力和全身不適；或出現惡心、嘔吐、腹瀉等胃腸反應，一般1～2天可自行消失。

而若是恰好患有上呼吸道感染、腹瀉或其它疾病時，一是有本身疾病的臨床表現，如咳嗽、流涕、腹瀉等表現外，有的可出現相應的體征。大便檢查、胸片等可以幫助鑒別診斷，以排除是否接種時間上的偶合疾病。既不要把一些適逢在免疫接種時期偶合的疾病誤診為接種副反應，而延誤對疾病的治療，也不要把真正的免疫接種副反應排除，忽視了與免疫接種的關系，這樣不利于免疫接種的實施及生物制品質量的改進。